日本最大的島嶼

本州島上有多條河流，其中信濃川是日本最長的河流。沿本州島的北部有山脈從東北一直延伸到西南，本州島的山區也是島上西南與東北氣候差異如此之大的原因。

本州島地形崎嶇，位於亞歐板塊和太平洋板塊的消亡邊界上，因而多火山和地震。面積，中部為中央高地，赤石山脈有多處3000米左右的高峯，山間有一系列盆地羣。富士火山帶由中部延伸到太平洋中的小笠原羣島、伊豆諸島。

大部為温帶海洋性季風氣候，初夏有梅雨，秋季多台風。大部分地區温和濕潤，但南北、東西有明顯差異。年平均氣温，北部的青森市為9.6℃，西南端的下關市為15.5℃，相差近6℃；最冷月平均氣温北部為-2℃左右，西南端為5.5℃；最暖月平均氣温北部22.5℃，西南端26.7℃。